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ADMET Predictor-ADMET性质及建模软件
 
       

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模块1--理化性质及生物药剂学性质预测模块

通过该模块可预测化合物的理化、生理药剂学、转运、分布等方面的参数,指导化合物的吸收、分布等方面的性质评价与筛选:

溶解性

- 化合物在亲水性介质中的溶解度
  水中的溶解度;溶解度 vs. pH曲线

- 胃肠液中溶解度

  模拟胃液、肠液中的溶解度

 pKa 

-酸性、碱性或混合状态

脂溶性

- logP (中性条件下)

- logD vs. pH曲线

渗透性

- 人空肠中的有效渗透率 (Peff)

- MDCK细胞膜表观渗透系数

- 兔子眼角膜渗透性

- 人皮肤渗透性

血脑屏障透过率

-提供定性预测模型 (low or high)

-提供定量预测模型 (logCbrain/Cblood)

空气-水分配系数

-Henry’s Law Constant

全血-血浆浓度比

-人或大鼠

对HIV整合酶的抑制活性

-3'端加工及链转移抑制活性

血浆蛋白游离药物分离

人肝微粒体中的游离分数

人体表观分布体积Vd

转运体OATP1B1抑制性质

转运体P-gp的底物及抑制性质

模块2--代谢性质及代谢产物预测模块

 

通过该模块可预测化合物对CYPP450和UGT酶的抑制特性、为酶的底物否?代谢位点、代谢动力学、代谢途径及代谢产物等参数:

 

   功能                            预测的具体参数

 

代谢底物

预测是否为CYP P450酶的底物:涵盖1A2, 2A6, 2B6, 2C8, 2C9, 2C19, 2D6, 2E1, 3A49种亚型

预测是否为UGT酶的底物: 涵盖1A1, 1A3, 1A4, 1A6, 1A8, 1A9, 1A10, 2B7, 2B159种亚型

 

代谢稳定性

CYP P450(1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4)介导代谢反应的米氏常数Km最大反应速率Vmax

CYP P450(1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4)

代谢活性:固有清除率CLint

 

抑制作用

预测化合物是否抑制CYP P450(1A2, 2C9, 2C9, 2D6, 3A4)

预测化合物对当咪达唑仑/睾酮的抑制活性及抑制常数Ki

 

代谢位点

CYP P4509种亚型介导发生的代谢位点(1A2, 2A6, 2B6, 2C8, 2C9, 2C19, 2D6, 2E1, 3A4)

 

代谢产物及

代谢途径

预测被CYP P450(1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4) 介导产生的代谢产物、代谢分数及相应的代谢途径

 

  代谢产物与途径预测结果示例:

 

 

 

模块3--毒性预测模块

该模块可预测化合物的急性毒性、基因毒性、肝脏毒性、环境毒性等多种毒理作用的参数:

急性毒性
• 半数致死浓度 LD50 (动物模型:大鼠)
致癌性
• 大鼠半数中毒剂量 TD50
• 小鼠半数中毒剂量 TD50
基因毒性
• 染色体变异性
• 致突变:Ames试验(10株沙门氏菌)
生殖毒性
心脏毒性预测
• hERG 编码的钾离子通道结合力
• pIC50 (定性及定量预测)
肝脏不良反应
• 5 种肝药酶的综合毒性反应

过敏性
• 皮肤过敏性
• 呼吸过敏性
内分泌毒性
• 雌激素受体毒性(大鼠模型)
• 雄激素受体毒性 (大鼠模型)
环境毒性
• 半数致死浓度LC50(模型:黑头鱼)
• 半数致死浓度pLC50(模型:大型溞 )
• 半抑制毒性浓度pIGC50(模型:梨形四膜虫)
• 生物富集系数 Bioconcentration Factor
• 生物降解的可能性
磷脂质病 Phospholipidosis

最大建议治疗剂量

模块4--生物利用度预测模块

通过该模块,可预测化合物在大鼠或人体内口服不同剂量后的吸收百分数以及生物利用度;还可设定血浆中的目标稳态浓度,预测所需的给药剂量

预测口服吸收与生物利用度需 以下两部分参数

通过结构式预测得到化合物的理化与代谢参数或实验数据;

• 大鼠或人体的生理学模型参数,软件已内嵌

如要预测吸收百分数、生物利用度、剂量等参数,用户可采用默认参数,也可自定义相关的参数。

              模块5--自建模型模块

通过该模块,可通过实验室或文献的化合物数据搭建新的活性、性质等QSAR/QSPR预测模型。目前人工智能的机器学习领域,人工神经网络ANN与支持向量机SVM是最主流的算法;ADMET Predictor自建模型模块也采用了人工神经网络,支持向量机;除此之外,还提供了偏最小二乘法PLS、多重线性回归MLR的建模方法、您可根据自己的化合物选择合适的建模方法,快递的搭建新的预测模型,并保持作为新的预测模型

 

人工神经网络ANN        支持向量机SVM          偏最小二乘法PLS        多元线性回归MLR

用人工神经网络ANNE搭建QSPR模型

筛选出TOP33个的模型,并自动提示哪个为最优模型,点击模型可查看并进行参数调整

模块6--药物设计模块 

  • 药物设计与结构优化软件MedChem Studio整合到ADMET Predictor新版本中;

  • 方便科研人员构建、筛选、 设计化合物库

ADMET Predictor的其他功能特色

提供化合物结构优化指导功能(DSA),为化合物的结构改造提供指导

   直观的数据可视化分析界面

性质分布状态

批量化合物同一属性参数分布特征

(区间分布个数、中位数、最大值、最小值等)

 相关性分析

对实验值与预测值进行相关性分析,以评估预测

结果的准确性;或对任意两参数进行相关性分析

3D/4D显示
便于对批量化合物数据进行深度挖掘与分析

 (可对三个参数或四个参数进行相互关系分析)

 

星绘显示

对同一化合物的多个参数进行整合 ,

更加直观明了考察化合物的成药性

 

官能团显示

便于用户更加快捷查找同类官能团或结构

 类似化合物

 

热图显示

对批量化合物的某一参数进行标示、排序

 便于您快捷查看参数分布情况

 

化合物成药性ADMET-Risk打分规则

  • 软件根据世界药物索引(WDI)的药物性质,统计并创建了ADMET_Risk的成药性评分规则。

  • 用户可对打分规则自定义,创建适合自身化合物的评分规则。

 

 

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