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ADMET Predictor-ADMET性质及建模软件

       

模块1--理化性质及生物药剂学性质预测模块

通过该模块可预测以下性质参数,指导化合物的吸收、分布等方面的性质评价与筛选:

溶解性

- 化合物在亲水性介质中的溶解度
  水中的溶解度;溶解度 vs. pH曲线

- 胃肠液中溶解度

  模拟胃液、肠液中的溶解度

 pKa 

-酸性、碱性或混合状态

脂溶性

- logP (中性条件下)

- logD vs. pH曲线

渗透性

- 人空肠中的有效渗透率 (Peff)

- MDCK细胞膜表观渗透系数

- 兔子眼角膜渗透性

- 人皮肤渗透性

血脑屏障透过率

-提供定性预测模型 (low or high)

-提供定量预测模型 (logCbrain/Cblood)

空气-水分配系数

-Henry’s Law Constant

血浆蛋白结合率

-人或大鼠

人肝微粒体中的游离分数

人体表观分布体积Vd

全血-血浆浓度比

-人或大鼠

对HIV整合酶的抑制活性

-3'端加工及链转移抑制活性

转运体OATP1B1抑制性质

转运体Pgp的底物及抑制性质

模块2--代谢性质及代谢产物预测模块

 

通过该模块可预测化合物对CYP P450和UGT酶的抑制特性、是否酶的底物、代谢位点、代谢动力学、代谢途径及代谢产物等参数:

 

功能预测的具体参数

 

代谢底物

预测是否为CYP P450酶的底物:涵盖1A2, 2A6, 2B6, 2C8, 2C9, 2C19, 2D6, 2E1, 3A49种亚型

预测是否为UGT酶的底物: 涵盖1A1, 1A3, 1A4, 1A6, 1A8, 1A9, 1A10, 2B7, 2B159种亚型

 

代谢位点

CYP P4509种亚型介导发生的代谢位点

(1A2, 2A6, 2B6, 2C8, 2C9, 2C19, 2D6, 2E1, 3A4)

 

代谢稳定性

CYP P450(1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4)介导代谢反应的米氏常数Km

最大反应速率Vmax

CYP P450(1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4)

代谢活性:固有清除率CLint

 

抑制作用

预测化合物是否抑制CYP P450(1A2, 2C9, 2C9, 2D6, 3A4)

预测化合物对当咪达唑仑/睾酮的抑制活性及抑制常数Ki

 

代谢产物及

代谢途径

预测被CYP P450(1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4)

介导产生的代谢产物、代谢分数及相应的代谢途径

 

  代谢产物与途径预测结果示例:

 

 

 

 

模块3--毒性预测模块

该模块可预测以下毒性参数,为进行早期药物安全性评价提供帮助。

急性毒性
• 半数致死浓度 LD50 (动物模型:大鼠)
致癌性
• 大鼠半数至毒量 TD50
• 小鼠半数至毒量 TD50
基因毒性
• 染色体变异
• 致突变:Ames试验(10株沙门氏菌)
生殖毒性
心脏毒性预测
• hERG 编码的钾离子通道结合力
• pIC50 (定性及定量预测)
肝脏不良反应
• 5 种肝药酶的综合毒性反应

过敏性
• 皮肤过敏性
• 呼吸过敏性
内分泌毒性
• 雌激素受体毒性(大鼠模型)
• 雄激素受体毒性 (大鼠模型)
环境毒性
• 半数致死浓度LC50(模型:黑头鱼)
• 半数致死浓度pLC50(模型:大型溞 )
• 半抑制毒性浓度pIGC50(模型:梨形四膜虫)
• 生物富集系数 Bioconcentration Factor
• 生物降解的可能性
磷脂质病 Phospholipidosis

最大建议治疗剂量

 

模块4--生物利用度预测模块

该模块可预测 化合物在大鼠或人体内口服不同剂量后的吸收百分数以及生物利用度;还可设定血浆中的目标稳态浓度,预测所需的给药剂量

预测口服吸收与生物利用度所需要的理化与代谢参数,可以基于结构式利用上述模块预测得到;大鼠或人体内的生理学参数,如胃肠道和组织器官的生理解剖学参数已内建在软件中。

您可采用默认参数,也可自定义相关的参数,以预测吸收百分数、生物利用度、剂量等参数。

 

    模块5--自建模型模块

通过该模块,用户可利用实验室或文献的化合物数据搭建新的活性、性质等QSAR/QSPR预测模型。程序提供了多种的建模方法,如人工神经网络、支持向量机、偏最小二乘法和多重线性回归,可根据您的化合物体系选择合适的方法,快速方便的搭建新的预测模型。

 

以ANNE为例的QSPR模型搭建

模块6--药物设计模块 

  • 将药物设计与结构优化软件MedChem Studio整合到ADMET Predictor新版本中;

  • 方便科研人员构建、筛选、计化合物库

ADMET Predictor的其他功能特色

提供化合物结构优化指导功能(DSA),为化合物的结构改造提供指导

   直观的数据可视化分析界面

性质分布状态

批量化合物同一属性参数分布特征

               (区间分布个数、中位数、最大值、最小值等)

 相关性分析

对实验值与预测值进行相关性分析,以评估预测

结果的准确性;或对任意两参数进行相关性分析

3D/4D显示
便于对批量化合物数据进行深度挖掘与分析

 (可对三个参数或四个参数进行相互关系分析)

 

星绘显示

对同一化合物的多个参数进行整合,

更加直观明了考察化合物的成药性

 

官能团显示

便于用户更加快捷查找同类官能团或结构

 类似化合物

 

热图显示

对批量化合物的某一参数进行标示、排序

 便于您快捷查看参数分布情况

 

化合物成药性ADMET_RISK打分规则

  • ADMET Predictor提供不同的成药性评分规则,这些规则统计来自于世界药物索引(WDI)中的药物分子性质参数

  • ADMET Predictor提供用户自定义打分规则功能,创建适合评价自身药物性质的评分规则

 

 

 

 

 

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